HBe antigenas atsiranda ūmiu infekcijos laikotarpiu, kai hepatito B viruso replikacijos greitis ir užkrečiamumas šiuo virusu yra didžiausias. Hepatito B viruso HBe antikūnai atsiranda sveikimo periodu nykstant iš kraujo Hbe antigenui, tai rodo ankstyvą imunitetą ir nedidelį užkrečiamumą.